El tratamiento se basa en la administración ininterrumpida de hormonas tiroideas. Como en la mayoría de los casos la disminución de la función de glándula tiroidea es definitiva, resulta imprescindible mantener el tratamiento durante toda la vida.

Si bien existen muchos preparados para la terapia hormonal, la levotiroxina es el de elección para el inicio de la misma.

El inicio del tratamiento debe realizase con precaución en los casos graves de evolución prolongada, en personas de edad avanzada, hipertensos, con arritmias e insuficiencia cardiaca.